Если вы получали разрешение на пребывание в Германии как супруга гражданина Европейского Союза, то и миграционный титул у вас должен быть соответствующий — карточка члена семьи гражданина Европейского Союза. А затем и постоянная карточка. Так как у вас есть право постоянного пребывания, то уведомлять ведомство о раздельном проживании вам не нужно.