Учёт прав на акции в электронной форме ведут депозитарии. Как правило, это обособленные структурные подразделения брокеров. Они фиксируют всю информацию о том, что и когда купили, и продали их клиенты. Эти же данные они отдают в центральный депозитарий РФ (Национальный расчётный депозитарий, НРД), который принадлежит Центробанку.
Вся эта инфраструктура устроена так, что «потеряться» акции не могут. Даже если брокер обанкротится, то клиент сможет перевести свои бумаги в депозитарий другого.
Определённый риск есть только, пожалуй, в случае преступных махинаций брокера. Чтобы избавиться от него, стоит выбирать крупных и известных брокеров с проверенной репутацией. Благо таких на рынке немало.