В 2016 году Самарская межрайонная природоохранная прокуратура выявила факты загрязнения Куйбышевского водохранилища сточными водами учреждения с превышенным содержанием загрязняющих веществ по железу, нитрат-иону, фосфатам, СПАВ и др. Надзорное ведомство обратилось с иском в Шигонский районный суд, который в мае 2016 года обязал предприятие прекратить сброс недостаточно очищенных сточных вод. Как сообщает природоохранная прокуратура, ФГБУ "Санаторий "Волжский Утес" устранило отмеченные нарушения, в связи с чем судебным приставом-исполнителем в августе 2017 года прекращено исполнительное производство в связи с фактическим исполнением решения суда.
