Причина: залез вирус, нагружает VPS, из-за чего лагает даже ispmanager 6 (ОЗУ 95%, ЦП - 65%)
dr.WEb нашел вирусы, но ситуации это не исправило.
Лазил ещё сис.админ, в итоге теперь ещё и сайты белый экран показывают - скорее всего он что-то отключил.
Есть бекап сайтов.