哺乳類細胞では、染色体の１本１本は、約１Ｍｂ（メガベース＝１００万塩基対）のＤＮＡが球状に折り畳まれた「トポロジカルドメイン（ＴＡＤ）」と呼ばれる構造が数珠つながりになった形をとっており、複数のＴＡＤがさらに空間的にまとまった配置を取っている。この配置は、遺伝子の発現と密接な関わりがあるとされ、遺伝子が転写されやすいＴＡＤが集まった空間をＡコンパートメント、転写されにくい空間をＢコンパートメントと呼ぶ。核内での染色体の形や位置は細胞種によって異なり、細胞分化の際には染色体構造が変化すると考えられるが、ＴＡＤのようなＭｂレベルの階層でどのように変化するかは、全く分かっていなかった。
