Marcel Guilavogui est accusé d'avoir joué un rôle de premier plan dans la répression du meeting de l'opposition qui a fait plus de 150 morts et une centaine de femmes violées, le 28 septembre 2009 au stade de Conakry. À la tête d'éléments de la garde présidentielle, il a même été vu par des témoins en train de tirer sur la foule.