Санаторий «Красная Пахра» изначально строился как ведомственный для строителей, однако
Постановлением Совета Министров СССР от 16 июля 1957 года и решением Мосгорисполкома от 8 августа 1957 года санаторий отдали детям. Впервые санаторий принял детей 1 июля 1958 года.
У истоков создания санатория стояли советские ученые: директор НИИ ревматологии АМН академик Нестеров А.И. и профессор Долгополова А.В. В 50-60 годы в санатории проводилось этапное долечивание больных ревматизмом в активной и неактивной фазе. В 1960 году санаторий стал базой Детской клиники НИИ ревматологии. В 1961-1964 гг. была проведена большая работа по профилактике ревматизма и его рецидивов, внедрена в практику профилактика «бициллином-1», «бициллином-5». За эти работы санаторий был награжден Дипломом ВДНХ II степени.
Достижения советских ученых в борьбе с ревматизмом в нашей стране привели к снижению заболеваемостью острым ревматизмом и его распространенностью. В связи с чем изменились структура и профиль санатория. Все шире стали приниматься на лечение дети с различными заболеваниями сердечно-сосудистой системы неревматической природы (артриты, врожденные пороки сердца, вегето-сосудистые дистонии, кардиопатии различной этиологии).
