Les enfants ont été découverts par le père qui a donné l'alerte, a indiqué à l'AFP une source à la gendarmerie.
Dêpéchés sur place vers 12H30, les secours n'ont pu que constater les décès, ont précisé les pompiers, confirmant une information du Dauphiné Libéré.
Selon le quotidien régional, l'homme qui a découvert les corps est le père du plus jeune des enfants.
Une soixantaine de gendarmes et un hélicoptère sont mobilisés pour les recherches, a précisé à l'AFP une source proche de l'enquête.
Les trois enfants présentaient des plaies par arme blanche, d'après le quotidien Le Parisien.
Taninges est une commune de 3.500 habitants dans la vallée du Giffre, à environ 50 km à l'est de Genève.
Le procureur de Bonneville, qui s'est rendu sur place, n'était pas joignable dans l'immédiat.
La semaine dernière, deux enfants de un et quatre ans ont été retrouvés décapités chez eux à Sainte-Rose, en Guadeloupe, et la mère, retrouvée errante dans les rues de la commune, a été internée en hôpital psychiatrique.
Selon l’Observatoire national de la protection de l’enfance, 60 mineurs sont décédés de mort violente au sein de leur famille en 2022.