Против нее возбуждено уголовное дело об оправдании терроризма. Как сообщила «Эху Москвы» сама Прокопьева, она жалуется на нарушение своих прав журналиста, на обыски и изъятие носителей информации и нарушение журналистской тайны.
После самоподрыва молодого человека в приемной архангельского ФСБ Прокопьева отмечала в авторском эфире, что власти сами доводят людей до таких поступков.