«Молекулярные часы» для бактерий разработали в СевГУ | Новости науки

Ведущий научный сотрудник Института перспективных исследований Севастопольского госуниверситета Михаил Шейнман с коллегами из Германии и Франции разработал математическую модель, которая позволяет на основе анализа генома бактерий восстановить их эволюционную историю. Об этом сообщила пресс-служба вуза.
Бактерии не сохраняются в окаменелостях, поэтому хронологию и филогению их эволюции проследить трудно. По словам ученых, анализ бактериальных геномов провести довольно сложно из-за их пластичности, большого расхождения последовательностей и горизонтального переноса генов. Кроме того, разные гены бактерий мутируют с разной скоростью. В результате бактериальный геном превращается в сложную мозаику, фрагменты которой имеют разную эволюционную историю.

С помощью разработанного математического алгоритма ученые связали в одну модель эмпирические данные изучения бактерий с их эволюцией. Они смогли отделить сходства последовательностей, унаследованные от их общих предков, от сходств, полученных посредством горизонтального переноса генов. В результате появилась возможность напрямую по геномам определить время расхождения бактериальных видов, решив таким образом давнюю проблему микробной геномики.

Работа Михаила Шейнмана описана в статье, опубликованной в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.