Место, названное как Глубокое, известно по писцовым книгам с 1515 года, а название связывают с наличием в округе пяти глубоких озёр. Завещание, в котором говорится о строительстве в 1628 году католического костёла, подписал владелец части местечка Глубокое воевода Юзеф Корсак. Деревянный костёл построили, но в 1654 году он сгорел в ходе войны между Речью Посполитой и Московской державой, которая боролась за возвращение утерянных Россией в Смутное время территорий.