Вся его жизнь была связана с железной дорогой. Прошёл трудовой путь от слесаря депо Иловайская до начальника Вологодского отделения Северной железной дороги. В 1977 году был назначен первым заместителем начальника Северо-Кавказской железной дороги, а в 1980 году возглавил СКЖД.
Как
сообщалось в «Нашем времени», за время его работы в этой должности построили 11 новых железнодорожных линий, грузовую станцию Ростов-Западный, сортировочные узлы на станциях Батайск и Марцево, новый вокзал в Ростове. Труд его отмечен орденами и медалями.
В 1999 Фёдор Макарович Котляренко был удостоен звания почетный гражданин города Ростова-на-Дону, а в 2014 году стал почетным гражданином Ростовской области.
В декабре 2011 года пассажирскому электровозу ЭП1М (станция приписки Новороссийск) было присвоено имя «Федор Котляренко».
Мемориальная доска в честь Федора Котляренко появилась на фасаде станции «Батайск»