Анализ расходов в системе образования Эстонии, проведенный рабочей группой под руководством академика Яака Аавиксоо, показал, что удельный вес инвестиций, то есть расходов на строительство и ремонт зданий образовательных учреждений, вдвое превышает среднеевропейский уровень, а на зарплаты учителей тратится меньше среднего по Европе. Среди проблем также отмечается большая нехватка финансирования профессионального образования и отсутствие четких данных о том, на что фактически тратятся деньги в системе образования.