Adoptive T cell therapies rely on the production of T cells with an antigen receptor that directs their specificity toward tumor-specific antigens. Methods for identifying relevant T cell receptor (TCR) sequences, predominantly achieved through the enrichment of antigen-specific T cells, represent a major bottleneck in the production of TCR-engineered cell therapies. Fluctuation of intracellular calcium is a proximal readout of TCR signaling and candidate marker for antigen-specific T cell identification that does not require T cell expansion; however, calcium fluctuations downstream of TCR engagement are highly variable. We propose that machine learning algorithms may allow for T cell classification from complex datasets such as polyclonal T cell signaling events. Using deep learning tools, we demonstrate accurate prediction of TCR-transgenic CD8
+
T cell activation based on calcium fluctuations and test the algorithm against T cells bearing a distinct TCR as well as polyclonal T cells. This provides the foundation for an antigen-specific TCR sequence identification pipeline for adoptive T cell therapies.
Частные объявления в Вашем городе, в Вашем регионе и в России
Smi24.net — ежеминутные новости с ежедневным архивом. Только у нас — все главные новости дня без политической цензуры. "123 Новости" — абсолютно все точки зрения, трезвая аналитика, цивилизованные споры и обсуждения без взаимных обвинений и оскорблений. Помните, что не у всех точка зрения совпадает с Вашей. Уважайте мнение других, даже если Вы отстаиваете свой взгляд и свою позицию. Smi24.net — облегчённая версия старейшего обозревателя новостей 123ru.net. Мы не навязываем Вам своё видение, мы даём Вам срез событий дня без цензуры и без купюр. Новости, какие они есть —онлайн с поминутным архивом по всем городам и регионам России, Украины, Белоруссии и Абхазии. Smi24.net — живые новости в живом эфире! Быстрый поиск от Smi24.net — это не только возможность первым узнать, но и преимущество сообщить срочные новости мгновенно на любом языке мира и быть услышанным тут же. В любую минуту Вы можете добавить свою новость - здесь.