Наталья Васильевна была удостоена государственной награды за большой вклад в развитие отечественной науки и многолетнюю плодотворную деятельность.
Указом Президента Российской Федерации от 05.02.2024 № 91 «О награждении государственными наградами Российской Федерации» председатель Научного совета РАН по лесу, член-корреспондент РАН, директор Центра по проблемам экологии и продуктивности лесов Российской академии наук Наталья Васильевна Лукина награждена орденом Дружбы.