Церковь преподобного Мартиниана (1649) построена как усыпальница, накрывшая собой захоронение преподобного Мартиниана. Трапезная палата Ферапонтова монастыря – одна из древнейших каменных трапезных в нашей стране.
Экспозиция трапезной палаты посвящена истории Ферапонтова монастыря. Здесь можно увидеть древние антиминсы, деревянную раку преподобного Мартиниана, а также сохранившиеся подризник и фелонь преподобного.
В подклете трапезной палаты представлены собрание керамики, уникальная коллекция прялок из разных регионов Русского Севера, обширная коллекция деревянных ткацких станков, формы набоек для ситца, ткани с древними дохристианскими символами и отдельные предметы народного быта, иллюстрирующие жизнь крестьян Русского Севера.
Собор Рождества Богородицы – первая каменная постройка Белозерья и монастыря, представляющая первоклассный образец оригинальной ростовской архитектуры, сохранивший черты раннемосковских каменных построек. Роспись, состоящая из 300 композиций, занимает все поверхности стен, сводов, столпов, софитов окон и дверей.