مصرف کله پاچه می‌تواند منجر به افزایش فشار خون و بالا رفتن چربی و کلسترول در بدن شود. این غذا به دلیل داشتن چربی‌های اشباع، خطر ابتلا به نقرس و مشکلات کلیوی را افزایش می‌دهد؛ همچنین ممکن است باعث سوء هاضمه، نفخ و اسهال شود. مصرف بیش از حد کله پاچه نیز به چاقی و اضافه وزن منجر خواهد شد و افرادی که دچار فشار خون بالا هستند، باید از مصرف آن پرهیز کنند.
