کوه دنا، به دلیل شرایط اقلیمی و جغرافیایی خاص خود، زیستگاه بسیاری از گونه‌های در حال انقراض است و به عنوان یکی از ذخیره‌گاه‌های زیست‌کره در کشور شناخته می‌شود اما با چالش‌هایی برای حفاظت روبرو است. مشکلات زیرساختی و کمبود تجهیزات حفاظتی و نهادهای نظارتی کافی، تأثیرات منفی بر محیط زیست کوه دنا گذاشته است و نقش اصفهان برای حفاظت از این منطقه حیاتی است.
