Antes de su fallecimiento, Nilo Burga Malca se desempeñaba como presidente del directorio de Frigoinca. Fue bajo ese cargo que la Fiscalía lo sindicó como el líder de una presunta organización criminal que sobornaba a funcionarios del programa Qali Warma para obtener contrataciones con el Estado a nivel nacional.
En el marco de esa investigación, la Fiscalía allanó su domicilio junto a los de otros investigados por comercialización de conservas en mal estado al programa del Ministerio de Desarrollo e Inclusión Social, Qali Warma. Esto aconteció el último 17 de diciembre y, posteriormente, el 22 del mismo mes, un reportaje de Cuarto Poder evidenció que la inclusión de Burga Malca como proveedor de Qali Warma se dio cuando Freddy Hinojosa, actual vocero presidencia, dirigía dicho proyecto.
Días después, durante la noche del 25 de diciembre, Burga Malca fue hallado sin vida en el hotel Luz y Luna, ubicado en el distrito de Magdalena del Mar.
La hipótesis inicial apunta a que Nilo Burga habría atentado contra su propia vida, sin embargo, debido al contexto en el que acontece esta muerte no se descarta que haya sido asesinado. Por ello, la Fiscalía inició una investigación preliminar sobre su fallecimiento.
De acuerdo con la fiscal provincial Rocío Reyes, "se efectuó el levantamiento del cadáver, así como la inspección técnico policial en la escena del crimen con participación de peritos de criminalística de la PNP y personal forense del Instituto de Medicina Legal", comunicó la Fiscalía en una publicación de X.
Respecto a las circunstancias de su deceso, según el reporte policial, Burga Malca se registró en el hospedaje Luz y Luna y avisó que recibiría la visita de un amigo, el abogado Martín Julio Villalon Deliot. Esta persona llegó y al tocar a la puerta de la habitación 301, donde se encontraba Burga Malca, no obtuvo respuesta, por lo que avisó al personal de recepción.
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Un trabajador abrió la habitación usando un duplicado de la llave y fue entonces que encontraron a Burga Malca muerto junto a dos armas punzocortantes. Acto seguido llamaron a los bomberos, quienes acudieron y brindaron primeros auxilios, pero ya no se registraban signos vitales.
Tras ello, se comunicó a los efectivos policiales y a la Fiscalía de San Miguel y Magdalena.
Según su abogado, César Euscátegui — en una entrevista a RPP —, su patrocinado habría dejado un documento escrito antes de su deceso, que fue encontrado por la policía y, acto seguido, se lo entregó a la Fiscalía.
"Se ha iniciado una investigación para hallar las causas de la muerte y si ha habido un suicidio en realidad. Por el momento, tenemos conocimiento que él (Nilo Burga) habría dejado un documento escrito, que ahora está en poder de la Fiscalía, que va a ser evaluado para llegar a una conclusión", aseguró el abogado de Nilo Burga.
En detalle, Euscátegui narró que el documento se encontraba en el vehículo de su patrocinado en el Hotel Luz y Luna, en Magdalena. Asimismo, el letrado resaltó que dicha prueba que dejó Nilo Burga, que consta de varias hojas — y que habría estado dirigido a la familia — será materia de investigación.
