Lloveras ha sido interrogada durante hora y media por su responsabilidad en el papel de los ayuntamientos con ocasión del referéndum ilegal del pasado 1 de octubre. Según fuentes de la acusación, les habría recomendado participar en la consulta pese a las prohibiciones del Tribunal Constitucional basándose en lo señalado en tratados internacionales que no ha podido concretar.
Preguntada por la frase "por las buenas o por las malas" que Lloveras profirió en una de las conversaciones telefónicas intervenidas por la Guardia Civil que mantuvo con Josep María Jové -quien fue número dos del exvicepresidente de la Generalitat Oriol Junqueras-, ha señalado que dicha afirmación quizá fue erróneamente transcrita por los agentes en el documento aportado a la causa.
Fue incluida entre los investigados por el instructor de la causa del 'procés' por los cargos que ejerció como presidenta de la AMI, organización que aparecía citada como miembro del comité estratégico del proceso soberanista catalán diseñado en el documento 'Enfocats'.
Al igual que al resto de investigados se le imputan indiciariamente delitos de rebelión, sedición y malversación de fondos públicos por haber tenido una participación principal y destacada en el desarrollo del 'procés'.
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