Las nuevas técnicas de secuenciación masiva nos permiten estudiar
las comunidades microbianas sin necesidad de cultivarlas. Comenzamos así a conocer la inmensidad del mundo microbiano que puebla todos los ecosistemas.
La microbiota es ese conjunto de microorganismos (
bacterias, arqueas, virus, hongos y protistas)
que residen en un ecosistema concreto, que puede ser desde una muestra de suelo, una planta hasta nuestro propio cuerpo. A veces se confunde con el término
microbioma, que es mucho más amplio y hace referencia al conjunto de esas comunidades microbianas incluyendo sus genes y metabolitos, así como las condiciones ambientales que les rodean. En nuestro organismo estos
ecosistemas microbianos se encuentran en
el tracto gastrointestinal, genitourinario y respiratorio, la cavidad oral y nasofaríngea y
la piel. El estudio de la microbiota humana es uno de los temas más fascinantes de la investigación actual.
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