Za národní tým Egypta El-Hadary debutoval v roce 1996, když mu bylo 23. Od té doby stihl odehrát více jak 159 zápasů. Na posledním MS v Rusku odchytal poslední skupinový zápas proti Saudské Arábii a polapil penaltu z nohy Al Muwallada. I přesto nezabránil prohře 2:1 a vyřazení Egypta ze skupiny s 0 body.
Za svojí 22 let dlouhou kariéru vyhrál jednou Arabské hry, 4x Africký pohár a v roce 2017 došel do finále, 4x také obdržel cenu pro nejlepšího brankáře Afriky a konečně - podíval se na MS.
"Tohle je moment, který jsem nechtěl aby přišel. Trénoval jsem tvrdě každý den a noc, abych podal co nejlepší výkon a mohl reprezentovat Egypt. Nakonec, díky bohu za všechno. Chci poděkovat i svojí rodině, obzvláště mému tátovi za neskutečnou podporu, která mi pomohla získat všechny moje úspěchy," napsal na Facebooku.
