Milan Černý byl členem úspěšné generace hráčů osmdesátých a devadesátých let. S hokejem začínal v Praze a za pražskou Spartu odehrál devět sezon a v roce 1989 byl u zisku titulu českých mistrů. Kromě Sparty hrál i za Duklu Jihlava a Plzeň.
Po skončení aktivní kariéry se přestěhoval na jih Čech, kde působil jako trenér českobudějovického týmu. V sezoně 2007/08 vedl Jihočechy společně s Josefem Jandačem v extralize.
Úspěchy ale sklízel i ve druhé české lize a podílel se hlavně na vzestupu hokeje ve středočeských Benátkách nad Jizerou.
Milan Černý ale hrál i na juniorském mistrovství světa 1982, odkud s českým výběrem přivezl stříbro. Jeho tehdejšími spoluhráči byli například Vladimír Růžička, Dominik Hašek, Petr Klíma, František Musil nebo Petr Rosol.