Добавить новость

Daily Mail: сиамские сестры-близнецы Хенсел из США намекнули на беременность

Столичную коммунальную технику украсили к новогодним и рождественским праздникам

В Подмосковье открыли новый рентген-кабинет

Москвичей предупреждают о гололедице



News in English


Новости сегодня

Новости от TheMoneytizer

Transcriptome analysis of two isolates of the tomato pathogen Cladosporium fulvum, uncovers genome-wide patterns of alternative splicing during a host infection cycle

by Alex Z. Zaccaron, Li-Hung Chen, Ioannis Stergiopoulos

Alternative splicing (AS) is a key element of eukaryotic gene expression that increases transcript and proteome diversity in cells, thereby altering their responses to external stimuli and stresses. While AS has been intensively researched in plants and animals, its frequency, conservation, and putative impact on virulence, are relatively still understudied in plant pathogenic fungi. Here, we profiled the AS events occurring in genes of Cladosporium fulvum isolates Race 5 and Race 4, during nearly a complete compatible infection cycle on their tomato host. Our studies revealed extensive heterogeneity in the transcript isoforms assembled from different isolates, infections, and infection timepoints, as over 80% of the transcript isoforms were singletons that were detected in only a single sample. Despite that, nearly 40% of the protein-coding genes in each isolate were predicted to be recurrently AS across the disparate infection timepoints, infections, and the two isolates. Of these, 37.5% were common to both isolates and 59% resulted in multiple protein isoforms, thereby putatively increasing proteome diversity in the pathogen by 31% during infections. An enrichment analysis showed that AS mostly affected genes likely to be involved in the transport of nutrients, regulation of gene expression, and monooxygenase activity, suggesting a role for AS in finetuning adaptation of C. fulvum on its tomato host during infections. Tracing the location of the AS genes on the fungal chromosomes showed that they were mostly located in repeat-rich regions of the core chromosomes, indicating a causal connection between gene location on the genome and propensity to AS. Finally, multiple cases of differential isoform usage in AS genes of C. fulvum were identified, suggesting that modulation of AS at different infection stages may be another way by which pathogens refine infections on their hosts.

Читайте на 123ru.net


Новости 24/7 DirectAdvert - доход для вашего сайта



Частные объявления в Вашем городе, в Вашем регионе и в России



Smi24.net — ежеминутные новости с ежедневным архивом. Только у нас — все главные новости дня без политической цензуры. "123 Новости" — абсолютно все точки зрения, трезвая аналитика, цивилизованные споры и обсуждения без взаимных обвинений и оскорблений. Помните, что не у всех точка зрения совпадает с Вашей. Уважайте мнение других, даже если Вы отстаиваете свой взгляд и свою позицию. Smi24.net — облегчённая версия старейшего обозревателя новостей 123ru.net. Мы не навязываем Вам своё видение, мы даём Вам срез событий дня без цензуры и без купюр. Новости, какие они есть —онлайн с поминутным архивом по всем городам и регионам России, Украины, Белоруссии и Абхазии. Smi24.net — живые новости в живом эфире! Быстрый поиск от Smi24.net — это не только возможность первым узнать, но и преимущество сообщить срочные новости мгновенно на любом языке мира и быть услышанным тут же. В любую минуту Вы можете добавить свою новость - здесь.




Новости от наших партнёров в Вашем городе

Ria.city

Россия выжила во время санкций, поменяв доллар на юань

Три исторических здания в стиле эклектики капитально отремонтировали в 2024 году

Два человека пострадали при столкновении фургона и автобуса в центре Москвы

Роман с Бодровым-младшим и три брака. Как сегодня живет Инна Гомес

Музыкальные новости

Концерт «Старые новые песни» проходит в Псковской областной филармонии

Начальник Управления Росгвардии по Удмуртской Республике принял участие в совещании по итогам праздничных мероприятий в новогоднюю ночь

СКА обыграл ЦСКА со счетом 6:3 в матче КХЛ

Кабинет Артиста в Яндекс. Кабинет Артиста в Яндекс Музыке.

Новости России

Нацпрокуратура Польши расследует дело об измене экс-министра обороны

В Ивановской области азербайджанская диаспора пыталась решить вопрос по уголовному делу мигранта из Азербайджана Аллахвердиева

Эстония в ближайшее время получит HIMARS из США

Змея выползла из вытяжки на кухне в Хорошово-Мневниках

Экология в России и мире

Исследование дежавю и жамевю: что происходит с нашей памятью?

Эйвазов о разводе с Нетребко: «Осознали, что живем разными интересами и разными жизнями»

Продвижение Песен, Музыки, Стихов ВКонтакте.

В 2024 году министры здравоохранения сменились в 27 регионах

Спорт в России и мире

Рублёв выпадет из топ-8 после поражения на турнире ATP в Гонконге

Боня в костюме страуса, укутанная салатом Шарапова, Долина со змеей на голове: эксперименты звезд со стилем в 2024-м

Русские теннисистки Андреева и Шнайдер выходят в финал WTA в Брисбене

Капризов стал лучшим снайпером года в НХЛ, Кудерметова прошла Касаткину. Главное к утру

Moscow.media

Продвижение Песни в Мою Волну музыкального стриминга Яндекс Музыка.

Ученые рассказали о сложностях секса в космосе (Big Think, США)

Из России в Дубай можно будет долететь напрямую

Врач рассказала, почему появляется седина и можно ли остановить этот процесс











Топ новостей на этот час

Rss.plus






Блинкен заявил об обеспокоенности США возможным применением РФ ядерного оружия

Нацпрокуратура Польши расследует дело об измене экс-министра обороны

Трамп заявил, что его инаугурация может пройти с приспущенными флагами

Магазин загорелся на площади 30 кв. м на востоке Москвы