Для поддержания в готовности окружных сил и средств Московской городской системы предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций (МГСЧС), предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций на территории Зеленоградского административного округа, обеспечения деятельности Комиссий по чрезвычайным ситуациям и пожарной безопасности округа в июле 2005 года было создано Агентство гражданской защиты Зеленоградского административного округа столицы.
В мае 2016 года Агентство преобразовано в окружное Управление и организационно включено в Департамент гражданской обороны, чрезвычайных ситуаций и пожарной безопасности столицы.
Бессменным руководителем Зеленоградского окружного Управления Департамента ГОЧСиПБ с 2005 года является Юрий Красоткин. Во взаимодействии с окружным управлением ГУ МЧС России по г. Москве, в рамках своей компетенции Управление обеспечивает на территории Зеленограда межотраслевое регулирование в области гражданской обороны, защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера, пожарной безопасности и безопасности людей на водных объектах, осуществляет региональный государственный надзор в области защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций, безопасность людей на водных объектах.
Управление по Зеленоградскому АО осуществляет свою деятельность в непосредственном взаимодействии с Префектурой округа, окружным управлением Главного управления МЧС России по г. Москве, управами районов округа, структурными подразделениями Департамента, такими как пожарно-спасательные отряды на территории округа, поисково-спасательная станция на Школьное озере, а также в пределах своей компетенции с органами исполнительной власти города Москвы, органами местного самоуправления города Москвы, организациями и предприятиями расположенными в Зеленограде.
По словам заместителя начальника управления Ирины Казаковой: «Две трети сотрудников Управления работают в организации практически со дня её основания и вносят большой вклад в развитие и совершенствование гражданской обороны округа, являются высококвалифицированными специалистами, многие из них имеют по нескольку высших образований, большой опыт службы и работы в ВС и МЧС РФ, показывают высокие результаты в своей работе».
Ветераны Управления, работающие в организации практически с её основания Александр Ядченко, Ирина Казакова, Александр Прядкин, Ольга Романова, Наталья Быковская, Алина Харламова, Ильюс Ахтариев, Марина Леонова, Сергей Купренков, Марина Гаврилова, Владимир Саврасов, Ирина Замковая, Елена Буртовая, Александр Колбасов.